Американские индейцы многих племен вернулись на остров в ноябре 1969 года. Алькатрас простоял без движения шесть лет, с тех пор как Бюро тюрем закрыло пенитенциарное учреждение. Никто не мог предложить реальный план повторного использования Алькатраса, поэтому активисты из числа американских индейцев захватили остров незадолго до Дня благодарения и объявили его землей индейцев. Это был получивший международную огласку политический протест, призванный привлечь внимание к бедственному положению американских индейцев.
Индейское движение уделяло большое внимание единству индейцев, и на Алькатрасе планировалось создать культурный центр американских индейцев. Одним из самых вдохновляющих оккупантов был Ричард Оукс, молодой студент из племени могавков, которого описывали как красивого, харизматичного и талантливого оратора. СМИ часто разыскивали его и называли Оукса лидером, вождем или мэром Алькатраса. Трагедия произошла в начале 1970 года, когда его юная падчерица Ивонна погибла при падении на острове. Вскоре после этого Ричард Оукс ушел, и "Оккупация" начала терять обороты.

В течение восемнадцати месяцев американские индейцы и их семьи жили на острове. Однако интерес общественности к оккупации ослабел, и порядок среди живущих на острове стал ухудшаться. В июне 1971 года федеральные маршалы выдворили с острова оставшихся оккупантов.

Захват Алькатраса сегодня признан важной вехой в истории американских индейцев. Многие индейцы считают, что захват Алькатраса стал новым началом, возрождением культуры, традиций, самобытности и духовности американских индейцев.

Каждый год индейцы всех племен возвращаются на остров Алькатрас в День Колумба и День благодарения, чтобы провести церемонию восхода солнца в честь коренных народов и в память об оккупации.

Более подробную информацию об индейской оккупации Алькатраса можно найти на сайте NPS history.