对许多移民来说，他们到达埃利斯岛的时间从一周到几个月不等。如果乘客有法律或医疗方面的问题，就会被带走，并被关押在位于主层入口附近的一个建筑医院的宿舍里。根据情况，这个人要么被留在岛上一周或一个月，要么被遣送回他们的原籍国。岛上的医院是美国最大的公共卫生医院之一。有二十二座医院大楼分布在两个岛上。由于医院的地位和其雇用了300多名医生、护士和其他医务人员的规模，该医院以吸引来自美国欧洲的医疗观察员而闻名。