واحدة من أهم "المعالم" التاريخية ، ولكن غالبا ما يتم نسيانها ، في جزيرة الكاتراز هي الاحتلال الأمريكي الأصلي ، الذي كان في المقدمة من 1969-1971.
ابتداء من 20 نوفمبر 1969 ، احتلت مجموعة من الأمريكيين الأصليين ، المعروفين باسم الهنود من جميع القبائل ومعظمهم من طلاب الجامعات من سان فرانسيسكو ، الجزيرة للاحتجاج على السياسات الفيدرالية المتعلقة بالهنود الأمريكيين. وكان بعضهم من أبناء الأمريكيين الأصليين الذين انتقلوا إلى المدينة كجزء من سياسة إنهاء خدمة الهنود التابعة لمكتب الشؤون الهندية (BIA)، وهي عبارة عن سلسلة من القوانين والسياسات التي تهدف إلى استيعاب الأمريكيين الأصليين في المجتمع الأمريكي السائد، وخاصة من خلال تشجيع الأمريكيين الأصليين على الابتعاد عن المحميات الهندية والدخول إلى المدن. كما احتل عدد من موظفي BIA Alcatraz في ذلك الوقت ، بما في ذلك دوريس بوردي ، وهي مصورة هاوية ، أنتجت لاحقا لقطات لإقامتها في الجزيرة.

وطالب المحتلون، الذين بقوا في الجزيرة لمدة عامين تقريبا، بتكييف مرافق الجزيرة وبناء هياكل جديدة لمركز التعليم الهندي ومركز البيئة والمركز الثقافي. طالب الهنود الأمريكيون بالجزيرة بموجب أحكام معاهدة فورت لارامي (1868) بين الولايات المتحدة وسيوكس. وزعموا أن المعاهدة وعدت بإعادة جميع الأراضي الفيدرالية المتقاعدة، المهجورة، أو غير المستخدمة إلى الشعوب الأصلية التي تم الحصول عليها منها. ثم طالب الهنود من جميع القبائل بجزيرة الكاتراز من خلال "حق الاكتشاف" ، حيث اكتشفتها الشعوب الأصلية قبل آلاف السنين من وصول أي أوروبيين إلى أمريكا الشمالية. بدأ الاحتلال من قبل الهنود الحضريين في سان فرانسيسكو ، واجتذب الأمريكيين الأصليين الآخرين من جميع أنحاء البلاد.
طالب الأمريكيون الأصليون بالتعويض عن العديد من المعاهدات التي خرقتها الحكومة الأمريكية وعن الأراضي التي تم الاستيلاء عليها من العديد من القبائل. في مناقشة حق الاكتشاف، يقول المؤرخ تروي جونسون في كتابه "احتلال جزيرة الكاتراز"، إن الشعوب الأصلية كانت تعرف عن الكاتراز قبل 10000 عام على الأقل من معرفة أي أوروبي بأي جزء من أمريكا الشمالية.

خلال تسعة عشر شهرا وتسعة أيام من الاحتلال من قبل الهنود الأمريكيين ، تضررت العديد من المباني في Alcatraz أو دمرتها النيران ، بما في ذلك قاعة الترفيه وأحياء خفر السواحل ومنزل السجان. أصل الحرائق متنازع عليه. هدمت الحكومة الأمريكية عددا من المباني الأخرى (معظمها شقق) بعد انتهاء الاحتلال. لا تزال الكتابة على الجدران من فترة احتلال الأمريكيين الأصليين مرئية في العديد من المواقع في الجزيرة اليوم.
خلال فترة الاحتلال، ألغى الرئيس ريتشارد نيكسون سياسة إنهاء الخدمة الهندية، التي صممتها الإدارات السابقة لإنهاء الاعتراف الفيدرالي بالقبائل وعلاقتها الخاصة مع الحكومة الأمريكية. وأنشأ سياسة جديدة لتقرير المصير، ويرجع ذلك جزئيا إلى الدعاية والوعي اللذين خلقهما الاحتلال. انتهى الاحتلال في 11 يونيو 1971.

لمزيد من المعلومات حول الذكرى السنوية لاحتلال الأمريكيين الأصليين، يرجى زيارة: https://www.alcatrazcruises.com/programs-and-events/annual-events/american-indian-occupation-anniversary/