1934 年，军队将恶魔岛移交给民事监狱管理局（BOP）。监狱局迅速将这座老旧的军事监狱改建成了一座安全级别最高、设施最先进的民用监狱。恶魔岛很快成为美国历史上最著名的联邦监狱。
恶魔岛被设计为美国第一所最高安全级别、最低特权的监狱，也就是今天所说的 "超级最高级别 "监狱。从1934年到1963年，恶魔岛关押了一些美国最臭名昭著的罪犯、越狱者、帮派头目和一般麻烦制造者。他们被关押在最安全、最严格的条件下，在旧金山海湾中央的岩石岛上，在几乎无法逃脱的环境中。对被送往那里的人来说，恶魔岛就是终点。

恶魔岛有时被称为 "监狱系统中的监狱"，因为被送到这里的囚犯都是从其他联邦监狱转来的。法院不能将任何人判入恶魔岛。相反，"岩石 "是BOP关押最麻烦囚犯的地方，直到决定可以将他们安全地送回安全级别较低的监狱。平均关押时间为五年。

在联邦监狱运营期间，有 36 名囚犯参与了 14 次不同的越狱企图。23 人被抓获，6 人被枪杀，2 人溺水身亡。有五名囚犯失踪，再也没有人见过他们，但绝大多数人都认为他们是淹死的，而且他们的尸体再也没有被打捞上来。

1963年初，司法部长罗伯特-肯尼迪以维护和运营成本增加为由，下令关闭恶魔岛监狱。1963年3月21日，最后一批囚犯被带离恶魔岛。恶魔岛关闭后，取而代之的是位于伊利诺伊州马里恩的一座新的最高戒备联邦监狱。

如今，政府的 "超级最高 "监狱位于科罗拉多州的佛罗伦萨。它的非官方绰号是 "落基山脉的恶魔岛"。

有关恶魔岛美国监狱的更多信息，请访问监狱管理局官方网站：BOP Alcatraz history。